1- فحص جميع السلع المستوردة الخاضعة لأحكام قوانين الأشعاعات المؤينة والوقاية من مخاطرها ومراقبة الأغذية والزراعة والاستيراد و التصدير المشار إليها ، وبالنسبة لما يستورد من هذه السلع بنظام السماح المؤقت يقتصر الفحص على إجتياز الاختبارات الميكروبيولوجية و الآفات المحجرية والحشرية .

2- فحص جميع السلع المصدرة الخاضعة لأحكام قوانين الإشعاعات المؤينة و الوقاية من مخاطرها و مراقبة الأغذية و الزراعة والإستيراد و التصدير المشار إليها .

3- الإشراف على فحص ورقابة السلع المصدرة والمستوردة الخاضعة لأحكام قواعد الرقابة على المصنفات الفنية وقمع التدليس والغش و مزوالة مهنة الصيدلة والمواد السامة و غير السامة التى تستخدم فى الصناعة والرقابة على المعادن الثمينة وحماية الأثار والوزن والقياس و الكيل .

4- التأكد من الإلتزام بنظام التتبع بالنسبة للسلعة الخاضعة لهذا النظام وفقاً للقواعد التى يصدر بها قرار من الوزير المختص بالتجارة الخارجية .

5- فحص السلع التى يطلب أصحاب الشأن فحصها اختياريا .

6- إجراء التحاليل التى تطلبها أى من الجهات أو الأشخاص .

7- إصدار شهادات المنشأأو المرور للصادرات من السلع المصرية المنشأ أوالمكتسبة المنشأ المصرى المصدرة إلى الدول المبرم بينها و بين مصر إتفاقيات تجارية ثنائية أو إقليمية أو متعددة الأطراف تتمتع مصر بموجبها بمعاملات تفضيلية فيما عدا ما ورد بشأنه نص خاص فى أى من هذه الإتفاقيات .
إمساك السجلات التجارية الآتية :
      * سجل المصدرين
      * سجل المستوردين
      * سجل الوكلاء والوسطاء التجاريين
      * سجل المكاتب العلمية والاستشارية
      * سجل بطاقات التكامل مع السودان

5- نشاط الفرز للمحاصيل الزراعية بهدف تحديد رتبة هذه المحاصيل .

6- الأشتراك مع التوحيد القياسي في تعديل المواصفات الخاصة بالسلع الصناعية والغذائية المستوردة.

7- طبع الكتب الاسترشادية لخطوات الخدمات المقدمة من الهيئة .

8- طبع الأبحاث المتعلقة بالسلع المصدرة من حيث توضيح أهم المشاكل والحلول المتعلقة بها .

9- تصميم وطبع البروشورات لتسهيل وتعريف المتعاملين مع الهيئة بأهم الخطوات والإجراءات لتقديم الخدمة .

10- طبع الكتب الخاصة بالجهات التابعة للوزارة .

11- طبع النشرات الدورية للتسجيلات التجارية .

12- فحص عينات التعاقد بالنسبة للسلع الصناعية المستوردة .